Для оформления приходного документа (Поступление товара) необходимо создать Закупку у поставщика (подробнее описано тут)
Если в поступлении присутствует номенклатура, цена которой отличается от ранее заведенной цены, то для такой номенклатуры необходимо создать новую серию (отличную от предыдущей), и создать документ Установка цен номенклатуры с указанием даты на день раньше даты входящего документа.
Для оформления расходного документа (Отпуск в отделение) необходимо создать Отпуск товаров в отделение (подробнее описано тут)