В систему заведена счет-фактура, в ней указано отнести к определенному периоду, а в книге покупок за данный период ее нет
Есть несколько причин по которым счет-фактура может не попасть в книгу покупок:
Если организация находится на общей системе налогообложения и используется раздельный учет НДС, то при включенной галке Цена включает НДС, проверяется под какую деятельность происходит закупка
Если закупается под деятельность облагаемую НДС, то такая счет-фактура попадет в книгу покупок
Если под деятельность не облагаемую НДС, то счет-фактура по такому поступлению не попадет в книгу покупок
Если под деятельность определяемую распределением, то в зависимости от дальнейшего расхода товара счет-фактура либо попадет в книгу, либо нет
Если происходит приобретение основного средства и оно не принято к учету, то такая счет-фактура не попадет в книгу покупок
Если в счет-фактуре указано, что ее нужно отнести к другому периоду
Так же бывает проблема «лишних» счет-фактур, которые могут попасть в книгу покупок, если не выверены счета 60.02 и 76.ВА. Такое случается при неоперативном вводе документов оплаты и поступления товаров. Когда сначала вводятся только банковские и кассовые документы, то могут быть сформированы проводки по дебету счета 60.02, а по ним счета-фактуры на аванс.
Если затем общим списком ввести документы поступления товаров, то по ним тоже сформируются счета-фактуры. И те, и другие попадут в книгу покупок. Во избежание такой ситуации нужно перед формированием счетов-фактур перепровести документы оплаты, чтобы выстроить правильную последовательность документов и сформировать корректные проводки.