Для оформления приходного документа (Поступление товара) необходимо создать Закупку у поставщика (подробнее описано тут)
Если в поступлении присутствует серия номенклатуры, цена которой отличается от ранее заведенной цены, то для такой номенклатуры необходимо создать новую серию (отличную от предыдущей)
После создания приходного документа, необходимо завести цены. Для этого создать на основании него документ Установка цен номенклатуры (подробнее тут) с указанием даты на день раньше даты входящего документа.
Для оформления расходного документа (Отпуск в отделение) необходимо создать Отпуск товаров в отделение (подробнее описано тут)